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聚焦丨SDH科學數據基因組SAR構效分析,驅動高效藥物研發
來源:科學數據基因組

構效分析(Structure - Activity Relationship,簡稱 SAR)是藥物化學、化學和生物學等多個領域中一種非常重要的研究方法。構效分析主要是研究化合物的化學結構(包括分子的形狀、大小、官能團的種類和位置等)與其生物活性(如藥物的藥效、毒性、對特定靶點的親和力等)之間的關係。通過對這種關係的數據分析研究,科學家可以調整設計和優化化合物的方向,以達到快速找到具有高活性、降低毒性的先導化合物的目的。


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在新藥研發過程中,構效分析主要用於探究化合物理化性質與結構的關係,幫助科學家們更快速、便捷的找到分子結構的優化方向,幫助科學家們設計更有效的藥物分子。

具體應用包括:

1

 先導化合物優化‌ 

Leads

Optimization

加速確認先導化合物優化方向,構型、基團等影響,結合理化性質計算。指導科學家設計更具有生物活性、更好藥代動力學或低毒性分子結構。

2

 專利分析‌ 

Patent

Analysis

通過分析專利中的實施例和母核各位置取代基的變化情況,幫助設計新穎且具有創造性的分子,同時避免與已有專利的分子結構衝突,造成專利糾紛。

在進行SAR分析的過程中,科研人員通常會要對大量相似化合物的結構信息以及與其相關的活性數據的整合、關聯以及統計分析,以確定分子結構中的骨架、基團、構型以及電荷對各類活性指標的影響。


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此時,一款好上手、支持多源數據與可視化界面的數據分析工具勢必會大大提高構效分析的數據處理效率, 拉斯维加斯9888科技針對廣大藥物研發人員的需求,在科學數據基因組(SDH)中更新了科研工作表功能。在科研工作表中,可對來自不同數據源的結構和活性信息進行整合,對骨架和基團進行拆分和歸類,並形成各類可視化圖表,可以大幅度提高分子篩選效率。


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  SDH科學數據基因組平台

結合中山大學的一篇科研文獻:《Rational design, synthesis and structure-activity relationships of 4-alkoxy- and 4-acyloxy-phenylethylenethiosemicarbaz-one analogues as novel tyrosinase inhibitors》中的數據,拉斯维加斯9888來看一下SDH的科研工作表的實際應用場景。

該文獻主要研究的是酪氨酸酶抑制劑(tyrosinase inhibitors),酪氨酸酶(Tyrosinase)是多酚氧化酶(PolyPheno Oxidase,PPO)的一種,存在於人的皮膚黑素細胞中,是皮膚黑素生成反應的關鍵。黑素(Melanin)在正常情況下能夠保護人體皮膚不受到紫外線傷害,但黑素的過量生成和累積也會極大地增大黑色素瘤的風險。同時,新的研究也發現酪氨酸酶活性也與帕金森綜合徵等神經退化疾病有一定的關聯性。文獻中描述了一系列基於4-烷氧基-和4-乙酰氧基-苯乙基二硫代氨基脲類似物的酪氨酸酶抑制分子合成、各分子酪氨酸酶半數抑制濃度(IC50)的測定以及相關構效分析。


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4-烷氧基-和4-乙酰氧基-苯乙基二硫代氨基脲類似物的基礎分子結構

Step

1

將該文獻中所涉及的分子結構信息與IC50值導入至SDH的科研工作表中:


SDH2.png

Step

2

信息導入後,對各個分子進行骨架識別和基團拆分,便於查看基團和骨架對於各分子IC50值的影響:


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SDH科研工作表支持多種骨架識別算法


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完成骨架識別與基團拆分

Step

3

完成骨架識別和基團拆分後,拉斯维加斯9888可以利用科研工作表的熱力圖、氣泡散點圖工具,對各分子的骨架和基團與IC50值的關聯關係進行分析:


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氣泡散點圖:X軸為含氧基團R1,Y軸為含氮基團R2,氣泡大小與IC50值大小正相關


從氣泡散點圖可以觀察到,當R1位置的含氧基團發生變化時,分子的IC50值變化幅度較小,而當R2位置的含氮基團發生變化時,IC50值會發生大幅度變化。故拉斯维加斯9888可以推測該類分子的IC50值,主要受R2基團結構的影響,該結論與文獻的結論一致:

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文獻指出,R2基團對分子的酪氨酸酶抑制活性起到決定性作用,R1基團對分子的酪氨酸酶抑制活性起到輔助性作用。

由此可見,SDH科研工作表的SAR功能可以幫助科研人員快速識別分子基團對於其活性指標的影響,助力高效藥物研發。


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目前,拉斯维加斯9888科技及其母公司已遞交專利申請數十項,其中已獲得授權專利二十餘項。公司在AI技術和數碼化解決方案領域保持前瞻性和技術優勢,目前擁有超過千家用戶


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